我正在尝试对PCA进行因子分析,以显示观察结果组沿结果维度的不同位置。
x = data.frame(v1=c(10, 20, 5, 26, 2, 30),
v2=c(23, 31, 34, 63, 12, 7),
v3=c(2, 6, 1, 0, 3, 5),
group=c("A", "B", "A", "B", "A", "B"))
result <- PCA(x[1:3])
这将产生两个图形: Observations in PCA
我想要做的是,不是让观察值1到6分别位于第一张图中,而是让A组和B组组成,它们分别是其组分观察值的平均位置(1、3, A代表5,B代表2,4,6。
非常感谢您提出解决方案!
答案 0 :(得分:1)
您可以提取值并按组进行均值:
x = data.frame(v1=c(10, 20, 5, 26, 2, 30),
v2=c(23, 31, 34, 63, 12, 7),
v3=c(2, 6, 1, 0, 3, 5),
group=c("A", "B", "A", "B", "A", "B"))
result <- PCA(x[1:3])
values<-as.data.frame(result$ind$coord)
values$group<-x$group
final<-aggregate(. ~ group, values, mean)
plot(final$Dim.1,final$Dim.2,xlim=c(-2.5,2.5),ylim=c(-2.5,2.5))
abline(h = 0, v = 0, col = "gray60")
text(final$Dim.1,final$Dim.2-0.09,labels = final$group)