按R中的因子着色PCA图

时间:2014-01-06 18:23:04

标签: r pca

我一直在使用pcaMethods包在R中做PCA。在绘图时,我通过因子着色我的点数有些困难。

labels <- read.table("example", header=TRUE, sep=",")
groupings <- factor(labels$type)
plotPcs(pcResults, col=groupings)

文件“example”看起来像这样:

no, type
1, carrot
2, carrot
3, turnip
4, turnip
5, brussel

如果因素的数量有限,它会做我想要的,但是,当我有很多因素时,似乎没有足够的默认颜色和一些因素用相同的颜色绘制。解决这个问题的最佳方法是什么?

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