使用ggRandomForests在多个变量维度中的部分依赖

时间:2018-09-16 10:01:10

标签: r surface

我正在尝试根据此插图https://mran.microsoft.com/snapshot/2016-08-24/web/packages/ggRandomForests/vignettes/randomForestSRC-Survival.pdf-附录A中的源代码来实现3D表面依赖图。

一次使用以下partial.rfsrc命令创建的时间表面:

partial_pbc_time <- partial.rfsrc(modello_, xvar.names = xvar,
                                  npts = 20, show.plots = FALSE,
                                      surv.type="surv")

将plot.variable输出列表转换为gg_partial时发生错误,即:

partial_time <- do.call(rbind,lapply(partial_pbc_time, gg_partial))
Error in UseMethod("gg_partial", object) : 
  no applicable method for 'gg_partial' applied to an object of class "character"

似乎无法对字符类使用gg_partial函数,但是partial_pbc_time不是字符类,它是"gg_partial_depend" "surv"类。

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