一个图中的多个部分依赖图

Question

我正在使用randomForest包Partialplot function。

我想在一个图中制作多个部分依赖图。我的论文发起人告诉我，可以保存它们（在环境中，我这样做了，我在列表中得到了一个列表对象'x'和'y'变量），但我不知道怎么回事保存后的图表。

我想做的是：

1。保存PD图

2。召回他们

3. 在一个图表中绘制多个PDP

Answer 1

请考虑使用plotmo包中的partialPlot函数，而不是使用plotmo函数。这将绘制单个页面上所有变量和变量对的图。例如：

library(randomForest)
data(trees)
mod <- randomForest(Volume~., data=trees)
library(plotmo)
plotmo(mod, pmethod="partdep") # plot partial dependencies

给出了

您可以使用plotmo的all1，all2，degree1和degree2参数精确指定要绘制的变量和变量对。其他示例位于vignette for the plotmo package。

Answer 2

使用pdp包。例子在论文中给出：https://journal.r-project.org/archive/2017/RJ-2017-016/RJ-2017-016.pdf。

Answer 3

完美！可以将图另存为格对象，然后调用。使用gridArrange或CowPlot进行绘制，并使用ggplot将它们漂亮化。很好的解决方案！