我有一个代码，可以在其中为文件设置变量
x <- file.choose()
pathtofile <- dirname(dirname(x))
print(pathtofile)
"/Volumes/Lab/Darwin/Patient6/Cells"
有没有办法像这样在终端上写入（路径文件）？
cd ~/Desktop
pwd
perl ~/Desktop/Scripts/perlscript.pl [pathtofile/txtfile.txt]
我还想知道Rmarkdown中是否有一个命令可以自动获取运行块并将其输出到终端而不是控制台上。我知道用于Mac的快捷键cmd + alt + enter，但我希望它可以自动化，并且与在控制台上运行的以前的块放在一起，以便它们像Rmarkdown的工作原理一样在一个块中运行。
```{terminal}
cd ~/Desktop
pwd
```
类似上面的操作，它将输出Desktop作为pwd