Autodock4的配体在活性位点具有蛋白质?

时间:2018-08-14 12:53:01

标签: bioinformatics pymol

我对Autodock4和蛋白质配体的对接是新手,我试图将我的配体与我的蛋白质(流感病毒A的Oseltamivir药物和Neuraminidase蛋白)对接,但该配体远离活性位点这种蛋白质,显然我必须在创建gpf文件的过程中添加一个gridbox规范或其他内容。

我正在使用Linux中的命令执行自动停靠工作,如果有人知道如何通过命令行使配体与活性位点结合,我将非常感激

autogrid4 -p myprotein.gpf

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