将数据拟合到python中的自定义模型

时间:2018-07-11 20:45:41

标签: python scipy curve-fitting

嗨,所以我相当熟悉python,但这是我第一次使用python进行数据分析,我想知道您是否可以对我遇到的问题有所了解。

我需要为以下功能拟合约4000个不同的图: b+e*A*(1.19104*(10**-16))*((x*(10**-9))**-5)*((-1+np.exp(0.0143878/(T*x*(10**-9))))**-1) 在此函数中,我想将b,e和A限制为每个图的某些值,并将变量T的值根据数据进行移位。

我尝试使用scipy优化,但无法弄清楚如何使用该参数保存参数。

我尝试使用pyAstronomy funcfit,但是它效率极低(或者我的代码是idk),而且我没有得到看起来像我估计的数据应该看起来像的数据。

最后,我目前正在尝试使用lmfit,但是这里的代码似乎所有参数都与猜测相同,并且完全没有差异。我对如何进行感到困惑。 我当前的代码如下:

def bbnm(x,b,e,T,A):
   y = b+e*A*(1.19104*(10**-16))*((x*(10**-9))**-5)*((-1+np.exp(0.0143878/(T*x*(10**-9))))**-1)
   return y     

params = bbmodel.make_params(b=0,e=.99,T=5100,A=wgeometry)
params['b'].vary = False
params['e'].vary = False
params['A'].vary = False
params['T'].vary = True
bb = bbmodel.fit(power[1465:2510],params,x=wavelength[1465:2510])

1 个答案:

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这里是将scipy的curve_fit参数限制在指定范围内的代码。在此示例中,第一个参数的界限为+/-无穷大(无界),第二个参数的界限为+/- 100,但拟合的参数在界限内且正常拟合,而第三个参数受其界限限制。

import numpy
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
from scipy.optimize import curve_fit

xData = numpy.array([5.0, 6.1, 7.2, 8.3, 9.4])
yData = numpy.array([ 10.0,  18.4,  20.8,  23.2,  35.0])


def standardFunc(data, a, b, c):
    return a * data + b * data**2 + c


# some initial parameter values - must be within bounds
initialParameters = numpy.array([1.0, 1.0, 1.0])

# bounds on parameters - initial parameters must be within these
lowerBounds = (-numpy.Inf, -100.0, -5.0)
upperBounds = (numpy.Inf, 100.0, 5.0)
parameterBounds = [lowerBounds, upperBounds]

fittedParameters, pcov = curve_fit(standardFunc, xData, yData, initialParameters, bounds = parameterBounds)

# values for display of fitted function
a, b, c = fittedParameters

# for plotting the fitting results
xPlotData = numpy.linspace(min(xData), max(xData), 50)
y_plot = standardFunc(xPlotData, a, b, c)

plt.plot(xData, yData, 'D') # plot the raw data as a scatterplot
plt.plot(xPlotData, y_plot) # plot the equation using the fitted parameters
plt.show()

print('fitted parameters:', fittedParameters)