标题 输出:
array(['Subject_ID', 'tube_label', 'sample_#', 'Relabel',
'sample_ID','cortisol_value', 'Group'], dtype='<U14')
身体 输出:
array([['STM002', '170714_STM002_1', 1, 1, 1, 1.98, 'HC'],
['STM002', '170714_STM002_2', 2, 2, 2, 2.44, 'HC'],], dtype=object)
testing = np.concatenate((header, body), axis=0)
ValueError Traceback (most recent call last) <ipython-input-302-efb002602b4b> in <module>()
1 # Merge names and the rest of the data in np array
2
----> 3 testing = np.concatenate((header, body), axis=0)
ValueError: all the input arrays must have same number of dimensions
有人可以解决此问题吗? 我尝试了不同的命令来合并两者(包括堆栈),并且遇到相同的错误。尺寸(列)似乎确实相同。
答案 0 :(得分:3)
您尝试使用numpy.concatenate()
是正确的,但是在连接之前,您必须将第一个数组提升到2D。这是一个简单的示例:
In [1]: import numpy as np
In [2]: arr1 = np.array(['Subject_ID', 'tube_label', 'sample_#', 'Relabel',
...: 'sample_ID','cortisol_value', 'Group'], dtype='<U14')
...:
In [3]: arr2 = np.array([['STM002', '170714_STM002_1', 1, 1, 1, 1.98, 'HC'],
...: ['STM002', '170714_STM002_2', 2, 2, 2, 2.44, 'HC'],], dtype=object)
...:
In [4]: arr1.shape
Out[4]: (7,)
In [5]: arr2.shape
Out[5]: (2, 7)
In [8]: concatenated = np.concatenate((arr1[None, :], arr2), axis=0)
In [9]: concatenated.shape
Out[9]: (3, 7)
结果连接的数组看起来像:
In [10]: concatenated
Out[10]:
array([['Subject_ID', 'tube_label', 'sample_#', 'Relabel', 'sample_ID',
'cortisol_value', 'Group'],
['STM002', '170714_STM002_1', 1, 1, 1, 1.98, 'HC'],
['STM002', '170714_STM002_2', 2, 2, 2, 2.44, 'HC']], dtype=object)
获得ValueError
的原因是,其中一个数组是1D,而另一个数组是2D。但是,在这种情况下,numpy.concatenate
期望数组的维数相同。这就是为什么我们使用arr1
提升 None
的数组维度的原因。但是,您也可以使用numpy.newaxis
代替None
答案 1 :(得分:0)
您需要先对齐数组尺寸。您当前正在尝试组合一维和二维数组。对齐后,您可以使用numpy.vstack
。
注意np.array([A]).shape
返回(1, 7)
,而B.shape
返回(2, 7)
。一种更有效的替代方法是使用A[None, :]
。
还请注意,您的数组将成为dtype object
,因为它将接受任意/混合类型。
A = np.array(['Subject_ID', 'tube_label', 'sample_#', 'Relabel',
'sample_ID','cortisol_value', 'Group'], dtype='<U14')
B = np.array([['STM002', '170714_STM002_1', 1, 1, 1, 1.98, 'HC'],
['STM002', '170714_STM002_2', 2, 2, 2, 2.44, 'HC'],], dtype=object)
res = np.vstack((np.array([A]), B))
print(res)
array([['Subject_ID', 'tube_label', 'sample_#', 'Relabel', 'sample_ID',
'cortisol_value', 'Group'],
['STM002', '170714_STM002_1', 1, 1, 1, 1.98, 'HC'],
['STM002', '170714_STM002_2', 2, 2, 2, 2.44, 'HC']], dtype=object)
答案 2 :(得分:0)
查看numpy.vstack和hstack以及np.append中的axis参数。在这里看起来像您想要的vstack(即输出数组将具有3列,每列具有相同的行数)。您还可以查看numpy.reshape,以更改输入数组的形状,以便可以将它们连接起来。