我有一个数据框df,其中包含2018年每小时通过伦敦地铁站的流量:
Year Month Day Hour Station.ID Traffic
1 2018 1 1 0 A 1000
2 2018 1 1 0 B 1300
3 2018 1 1 0 C 956
4 2018 1 1 0 D 721
...
它超过7,000,000行。我想要一种有效的方法来查找特定日期和时间的流量。例如,如果我想知道2018年4月5日上午10点在“ X”站的交通,我目前将执行:
df[df$Year==2018 & df$Month==5 & df$Day==4 & df$Hour==10 & df$Station.ID=='X',]$Traffic
但是此方法将不必要地浏览整个数据帧。我的想法是将数据组织成这样的层次结构:
library(data.tree)
df$pathString <- paste("MyTree",
df$Year,
df$Month,
df$Day,
df$Hour,
df$Station.ID,
sep = "/")
dftree <- as.Node(df)
我之前的请求现在类似于:
dftree$'2018'$'5'$'4'$'10'$X$Traffic
,这将加快几个数量级。我的问题是,实际上首先将df组织成一棵树会花费太长时间!如果我采用1000行的子集,则需要花费几分钟。所有700万行记录都消失不见了。
我的问题:
1)按日期组织数据时,最适合用于快速查找的数据结构是什么?
2)df是否太大,以至于该结构不合适?
答案 0 :(得分:0)
一个data.table
。
使用flights
数据集,像您这样的查询大约需要半秒钟:
library(data.table)
library(nycflights13)
flights <- as.data.table(flights)
flights7M <- rbindlist(lapply(1:22, function(x) flights))
nrow(flights7M) / 7e6 # close enough
#> [1] 1.058439
bench::system_time({
setkey(flights7M, year, month, day, hour, origin)
flights7M[.(2013L, 5L, 4L, 10L, "JFK")]
})
#> process real
#> 1.8s 587.4ms
由reprex package(v0.2.0)于2018-07-02创建。