我正在创建一个继承自ete3.Tree
的类。我想向对象添加newick
格式的字符串,但是我不知道更新对象的正确方法。 我希望下面的t2
与t1
具有相同的结构,按照这种结构,我的意思是要像构建t2
一样与构建t1
对象相同,但是来自空的ete3.Tree
对象。
import ete3
newick = "(((petal_width:0.098798,petal_length:0.098798):0.334371,sepal_length:0.433169):1.171322,sepal_width:1.604490);"
t1 = ete3.Tree(newick=newick, name="hello")
t2 = ete3.Tree(name="hello")
t2.add_child(child=ete3.Tree(newick))
print(t1 == t2)
print(t1.__dict__)
print()
print(t2.__dict__)
# False
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514b1c), Tree node 'sepal_width' (0x12aeb4a9)], '_up': None, '_dist': 0.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514ba1)], '_up': None, '_dist': 1.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
我该怎么做?我知道它们不会是相同的哈希,但是两个实例化之间的_children
属性看起来有所不同。
Python version 3.6.4
ete3 version: 3.1.1