给出成功比例加上样本大小和自变量的样本数据,我在R中尝试逻辑回归。
以下代码可以满足我的需求,并且似乎可以提供合理的结果,但看起来并不是一种明智的方法;实际上,它使数据集的大小加倍
datf <- data.frame(prop = c(0.125, 0, 0.667, 1, 0.9),
cases = c(8, 1, 3, 3, 10),
x = c(11, 12, 15, 16, 18))
datf2 <- rbind(datf,datf)
datf2$success <- rep(c(1, 0), each=nrow(datf))
datf2$cases <- round(datf2$cases*ifelse(datf2$success,datf2$prop,1-datf2$prop))
fit2 <- glm(success ~ x, weight=cases, data=datf2, family="binomial")
datf$proppredicted <- 1 / (1 + exp(-predict(fit2, datf)))
plot(datf$x, datf$proppredicted, type="l", col="red", ylim=c(0,1))
points(datf$x, datf$prop, cex=sqrt(datf$cases))
的图表
看起来相当明智。
但我对使用datf2
作为通过复制数据来分离成功和失败的方法感到高兴。这样的事情有必要吗?
作为一个较小的问题,是否有更简洁的方法来计算预测的比例?
答案 0 :(得分:7)
无需像这样构建人工数据; glm
可以根据给定的数据集拟合您的模型。
> glm(prop ~ x, family=binomial, data=datf, weights=cases)
Call: glm(formula = prop ~ x, family = binomial, data = datf, weights = cases)
Coefficients:
(Intercept) x
-9.3533 0.6714
Degrees of Freedom: 4 Total (i.e. Null); 3 Residual
Null Deviance: 17.3
Residual Deviance: 2.043 AIC: 11.43
你会收到关于&#34;非整数#sucescesses&#34;的警告,但这是因为glm
很愚蠢。与构建的数据集上的模型进行比较:
> fit2
Call: glm(formula = success ~ x, family = "binomial", data = datf2,
weights = cases)
Coefficients:
(Intercept) x
-9.3532 0.6713
Degrees of Freedom: 7 Total (i.e. Null); 6 Residual
Null Deviance: 33.65
Residual Deviance: 18.39 AIC: 22.39
回归系数(以及预测值)基本相等。但是,您的剩余偏差和AIC是可疑的,因为您已经创建了人工数据点。