Question

我有一个像这样的pandas DataFrame：

  Loc WT Var  Change AO     DP    VAF IntEx    Upstream  Downstream Individual
  0  10  A   T  C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT          1
  1  10  A   T  C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT          1
  2  10  A   T  C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT          1
  3  10  A   T  C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT          1

我正在尝试选择DataFrame的一部分，其中'Downstream'列中字符串的第一个字母是特定字母，但是当我尝试使用以下内容执行此操作时，我遇到了一个键错误：

a = allVariants[allVariants['Downstream'[0] == 'G']]

Answer 1

您正在寻找的条件是 -

df[df.Downstream.str[0].eq('G')]

或者，

df[df.Downstream.str.startswith('G')]

示例数据 -

df

   Loc WT Var Change  AO     DP    VAF IntEx    Upstream  Downstream  \
0   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT   
1   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  AGTCGATCGT   
2   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  GTCGATCGTA   
3   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  GTCGATCGTA   

   Individual  
0           1  
1           1  
2           1  
3           1

df[df.Downstream.str[0].eq('G')]

   Loc WT Var Change  AO     DP    VAF IntEx    Upstream  Downstream  \
2   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  GTCGATCGTA   
3   10  A   T    C>T  40  30000  0.003  Exon  ATGCTCGTAG  GTCGATCGTA   

   Individual  
2           1  
3           1

工作原理 -

Downstream是一个字符串列。您可以使用.str访问者访问第一个字符 - df.Downstream.str[0]。
使用'G'或eq将此值与==进行比较，以获取布尔值掩码。
最后使用掩码索引到df。

或者，调用.str.startswith会将第一个字符与传递的字符（'G'）进行比较，以返回类似于第一种情况的布尔掩码。

花式索引与大熊猫中的一部分字符串

1 个答案: