n维矩阵

时间:2017-10-18 22:37:05

标签: python numpy scipy

我有一个n维矩阵A,即nXn...Xn矩阵,我想计算矩阵中行的所有成对距离的总和。距离可以是欧几里德或任何其他规定的距离。

我尝试使用scipyscipy.spatial.distance.pdist中给出的示例,但它不适用于n维矩阵(需要文档中所述的mXn矩阵)。

对于2d矩阵,

A = [ a b c , 
      d e f ,
      g h i ]

所有可能的观察对之间的欧氏距离定义为

Sum = sqrt( (a-d)^2 + (b-e)^2 + (c-f)^2 ) ) +  sqrt( (a-g)^2 + (b-h)^2 + (c-i)^2 ) ) + sqrt( (g-d)^2 + (h-e)^2 + (i-f)^2 ) ) 

我想扩展上述2d矩阵距离的概念(取每个成对行并计算它们之间的距离)。

array([[[ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.]],

   [[ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.]],

   [[ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.],
    [ 0.,  0.,  0.]]])

使用矢量化计算相同的最快方法是什么?

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