带有偏移的泊松的cv.glmnet错误

时间:2017-10-05 14:32:50

标签: r cross-validation poisson glmnet offset

我尝试使用偏移在glmnet上为family = poisson运行交叉验证时遇到错误。

我设法用以下非常简单的例子复制错误:

library(glmnet)

#poisson
N=500; p=20
nzc=5
x=matrix(rnorm(N*p),N,p)
beta=rnorm(nzc)
f = x[,seq(nzc)]%*%beta
mu=exp(f)
y=rpois(N,mu)
exposure=rep(0.5,length(y))

#cross validation
cv=cv.glmnet(x,y,family="poisson",offset=log(exposure),nlambda=50,nfolds=3)

返回以下错误:

  

错误:没有为预测提供新的偏移,但在适合的情况下使用偏移   glmnet

我无法弄清楚我在这里做错了什么。并且无法在互联网上找到任何帮助。有人会有想法吗?

非常感谢!

  

编辑:此问题已过时,并已链接到2.0-12包的版本glmnet - 在更新为版本2.0-13

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

这有效: predict(cv,x,newoffset=log(exposure))

glmnet参数的offset文档:

  

如果提供,则还必须将值提供给预测   功能