Question

我尝试构建包含Parallel IO（1.7.2）的Fortran模型。但是我遇到了很多这样的错误：

pionfwrite_mod.F90:(.text+0x1bad): undefined reference to `nfmpi_iput_vara_'
pionfwrite_mod.F90:(.text+0x21ad): undefined reference to `__netcdf_MOD_nf90_put_var_1d_fourbyteint'
pionfwrite_mod.F90:(.text+0x22a9): undefined reference to `__netcdf_MOD_nf90_inquire_variable'
pionfwrite_mod.F90:(.text+0x27e5): undefined reference to `__netcdf_MOD_nf90_put_var_1d_fourbyteint'
pionfwrite_mod.F90:(.text+0x2ad7): undefined reference to `__netcdf_MOD_nf90_put_var_1d_fourbyteint'

我用Google搜索并找到了一些可能的解决方案，例如https://www.myroms.org/wiki/Frequently_Asked_Questions#Errors_at_link_time，但我仍然无法解决我的问题。

问题：这是一个链接问题的库吗？如果没有，你能否就如何调试给我一些建议？如果是这样，您能否分享一下如何链接图书馆的详细步骤？谢谢。

环境库：PnetCDF 1.8.1，netCDF 4.5.1，并行IO 1.7.2，gcc 7.1.1，openmpi-2.0.2-2.fc26.x86_64

Answer 1

我通过检查库路径并在本地文件夹中安装早期版本的netcdf和pnetcdf解决了我的问题。

此MPAS模型的makefile设置netcdf路径和库，如下所示：

ifneq "$(NETCDF)" ""
        CPPINCLUDES += -I$(NETCDF)/include
        FCINCLUDES += -I$(NETCDF)/include
        LIBS += -L$(NETCDF)/lib
        NCLIB = -lnetcdf
        NCLIBF = -lnetcdff
        ...
endif

而对于Linux F26，似乎使用DNF安装的netcdf（不确定DNF是否是原因）不构建单独的文件夹将所有相关文件放在$ NETCDF下，相关文件改为安装在/ usr /下local / include和/ usr / lib64

$ which netcdf
/usr/local/include/netcdf

$ which libnetcdf.so.11
/usr/lib64/libnetcdf.so.11

导致模型构建中的错误。

我试图修改makefile但它导致了许多其他错误。所以我保持makefile不变，并从单独的本地文件夹中的源构建单独的netcdf和pnetcdf，并使用相应的路径重建PIO并编译模型，这解决了我的问题。请注意，对于MPAS模型运行，这些pnetcdf和netcdf路径也应作为LD_LIBRARY_PATH添加到〜/ .bashrc中。可以在此处找到更多说明：http://www2.mmm.ucar.edu/projects/mpas/tutorial/UK2015/index.html。

未明确引用＆＃39;＆＃39; __ netcdf_MOD_nf90 _＆＃34;

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