Question

使用“missforest”软件包在R中执行数据插补时需要帮助以解决以下错误。

> imputed<- missForest(dummy, maxiter = 10, ntree = 100, variablewise = TRUE,
+                      decreasing = TRUE, verbose = TRUE,
+                      mtry = floor(sqrt(ncol(dummy))), replace = TRUE)
Error in sample.int(length(x), size, replace, prob) : 
  invalid first argument

Answer 1

有同样的问题。用as.data.frame转换xmis对象帮助。在你的情况下，它将是这样的：

dummy <- as.data.frame(dummy)    
imputed<- missForest(dummy, maxiter = 10, ntree = 100, variablewise = TRUE,
                      decreasing = TRUE, verbose = TRUE,
                      mtry = floor(sqrt(ncol(dummy))), replace = TRUE)

Answer 2

如果使用fread（）读取数据，请尝试使用read.csv（）代替。使用fread（）读取数据时，即使稍后通过使用as.data.frame（）将data.table转换为data.frame之后，我也遇到相同的问题。但是，稍后我使用read.csv读取了数据，问题得以解决。

Answer 3

我知道这是2岁，但是我偶然遇到了这个问题，试图解决这个问题并最终解决了这个问题，所以我猜想其他人也会这样做。

我拥有肿瘤学数据，并且在我的代码（站点代码1-8）旁边有书面说明（癌症所在）。您需要删除书面说明，以便您的电子表格/数据仅包含编码条目，然后missForest可以使用。

Answer 4

正如其他人所指出的，missForest() 要求输入数据属于 data.frame 或 matrix 类。如果像许多人一样，您使用 tidyverse 包的函数导入或操作数据，那么您的数据集很可能是 tibble（类 tbl_df）因此在输入缺失值之前需要使用 as.data.frame() 进行转换。
正如 OP 所说，他/她的数据包含在 data.frame 中，问题可能来自变量的类。根据{{3}}，如果您有日期变量（类date 或difftime），则会出现相同的错误消息。确保仅使用 numeric 或 factor 变量。

R中“missforest”出错

4 个答案: