sklearn RandomizedSearchCV提取不同折叠的混淆矩阵

时间:2017-08-28 08:56:41

标签: python scikit-learn cross-validation confusion-matrix

我尝试计算聚合的混淆矩阵来评估我的模型:

cv_results = cross_validate(estimator, dataset.data, dataset.target, scoring=scoring,
                cv=Config.CROSS_VALIDATION_FOLDS, n_jobs=N_CPUS, return_train_score=False)

但我不知道如何提取不同折叠的单个混淆矩阵。在得分手中,我可以计算出来:

scoring = {
'cm': make_scorer(confusion_matrix)
}

,但我不能返回comfusion矩阵,因为它必须返回一个数字而不是一个数组。如果我尝试它,我会收到以下错误:

ValueError: scoring must return a number, got [[...]] (<class 'numpy.ndarray'>) instead. (scorer=cm)

我想知道是否可以将混淆矩阵存储在全局变量中,但是没有成功使用

global cm_list
cm_list.append(confusion_matrix(y_true,y_pred))

在自定义得分手中。

提前感谢任何建议。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

问题是,在RandomizedSearchCV完成后我无法访问估算器,因为我不知道RandomizedSearchCV实现了一个预测方法。这是我的个人解决方案:

r_search = RandomizedSearchCV(estimator=estimator, param_distributions=param_distributions,
                          n_iter=n_iter, cv=cv, scoring=scorer, n_jobs=n_cpus,
                          refit=next(iter(scorer)))
r_search.fit(X, y_true)
y_pred = r_search.predict(X)
cm = confusion_matrix(y_true, y_pred)

答案 1 :(得分:0)

要返回每个折叠的混淆矩阵,您可以在每次迭代(折叠)中从度量模块调用confusion_matrix,这将为您提供一个数组作为输出。输入将是为每个折叠获得的y_true和y_predict值。

from sklearn import metrics
print metrics.confusion_matrix(y_true,y_predict)
array([[327582, 264313],
       [167523, 686735]])

或者,如果你使用pandas,那么pandas有一个交叉表模块

df_conf = pd.crosstab(y_true,y_predict,rownames=['Actual'],colnames=['Predicted'],margins=True)
print df_conf

Predicted       0       1     All
Actual                           
  0          332553   58491  391044
  1           97283  292623  389906
  All        429836  351114  780950