Question

我在r中使用DTWCLUST包。这是我的代码。

library(dtwclust)
sc1 <- read.table("D:/handling data/confirm4.csv", header=T, sep="," )
hc_sbd <- dtwclust(sc1, type = 'h', k=5L, method = 'ward.D', preproc = zscore,
                distance = 'dtw', control = list(trace=TRUE) )
clusters <- cutree(hc_sbd,6)
head(clusters)
result <- cbind.data.frame(sc1,clusters)
plot(hc_sbd, type='centroids', clus=1) + ylim(-3, 3) + scale_x_continuous( breaks = c(1,6,12,18,24,30,36,42), labels= real_label )

当我跑plot(hc_sbd, type='centroids', clus=1) + ylim(-3, 3) + scale_x_continuous( breaks = c(1,6,12,18,24,30,36,42), labels= real_label )时，绘制了原型。但我不知道PAM如何计算质心，这是默认选项。任何人都可以帮助我理解PAM获得质心的概念吗？提前谢谢。

Answer 1

在包中包含的实现中，来自数据的 k 系列被随机选择为初始质心。然后计算所有系列和质心之间的距离（如果是预先计算的，则从整个距离矩阵中检索），并且每个系列都分配给最近的质心的簇。对于每个创建的集群，计算所有成员系列之间的距离（如有必要），并且选择具有最小距离总和的系列作为新的质心。这将继续迭代，直到没有系列更改簇，或者已超过允许的最大迭代次数。

Here's the code

（如果您使用的是dtwclust 4.0.0或更高版本，则应该使用tsclust功能）

如何计算R中DTWCLUST库的Centroid

1 个答案: