Question

我尝试使用R中的doParallel包来减少代码的运行时间。

我正在调用一个函数awareRateSIR，在这个函数的主体中使用了一些额外的包。我得到一些错误，如

无法找到功能＆＃34; vcount＆＃34;和..

我知道vcount是igraph中使用的包awareRateSIR的函数，但它并不是唯一的。{1}}。我怎么解决这个问题？我以为我应该传递我的函数awareRateSIR中使用的所有包名，但我不知道如何在foreach中导出多个函数或者如何导出多个包名称。

这是我的代码：

tp<-foreach(i=1:iter,  .inorder = FALSE, .export = "awareRateSIR",
          .packages = "igraph", .packages="doParallel")%dopar%{
tp <- awareRateSIR(graphContact, graphCom,state)
return(tp)
}

如果我没有通过这些软件包，我会收到错误状态，如果我通过所有软件包，我会收到一些函数错误：

foreach中的错误（i = 1：iter，.inorder = FALSE，.export = ＆＃34; awareRateSIR＆＃34;，：正式参数＆＃34; .packages＆＃34;匹配多个实际论点＆＃34;

提前致谢

Answer 1

您应该使用c函数传递所需的所有包，如下所示：

tp<-foreach(i=1:iter,  .inorder = FALSE, .export = "awareRateSIR",
          .packages = c("igraph", "doParallel"))%dopar%{
tp <- awareRateSIR(graphContact, graphCom,state)
return(tp)
}

Answer 2

通常，在使用foreach时，您不需要导出任何变量，函数或包。

对于变量和函数，它们只需要与foreach语句位于相同的环境中（更好的方法是创建一个只传递所需内容的函数）。

当其他软件包需要函数时，您只需使用package::function，就像内部软件包一样。

如何在foreach循环中导出多个函数或包在＆＃34; R＆＃34;

2 个答案: