从PBS作业调用python脚本

时间:2017-08-10 09:09:41

标签: python bash delay pbs qsub

如何调用python脚本从pbs作业运行? 更多细节: 我目前正在使用以下形状的pbs文件(这部分工作正常,不应更改):

#!/bin/bash
#PBS -N # work name 
#PBS -q 
#PBS -l 
#PBS -S /bin/bash
#PBS -m 
##PBS -M #my email 
cd $PBS_O_WORKDIR

我必须修改它,所以在上面的计算结束后,将调用python脚本(适用于输出文件)。 计算需要几分钟才能完成,所以必须指定调用python脚本之前的延迟。我对bash编程一无所知,所以这对我来说真的很挣扎。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您只需要添加行来调用python脚本:

#!/bin/bash
#PBS -N # work name 
#PBS -q 
#PBS -l 
#PBS -S /bin/bash
#PBS -m 
##PBS -M #my email 
cd $PBS_O_WORKDIR
python3 my_python_script.py