在PBS作业脚本中获取壁垒时间

Question

当向PBS排队系统提交作业脚本时，自动指定挂壁时间或由用户指定挂壁时间，例如，通过

#PBS -l walltime=1:00:00

问题是如果可以从作业脚本访问此时间。是否有环境变量或其他方式来获得此壁挂时间。

最后，作业脚本应该不时地决定是否还有足够的时间做更多的工作，以便作业不会被排队系统杀死。

更新

至少如果用户在资源列表中指定了walltime，我可以建议以下解决方法（为bash工作）

read _ _ PBS_WALLTIME  <<< `qstat -f $PBS_JOBID | grep "Resource_List.walltime"`

从qstat输出解析walltime并将值放在PBS_WALLTIME变量中。因此，命令

echo $PBS_WALLTIME

将产生类似

的内容

1:00:00

Answer 1

它存储在环境变量$ PBS_WALLTIME中。

当然，那是TORQUE，我不确定你使用的是哪个PBS排队系统。

Answer 2

我一直在寻找答案，上面的评论给了我一个似乎很有效的想法。您可以使用qstat并使用sed：

从中获取相关信息

qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p'

将其放入PBS脚本中将打印出值，您可以使用标准bash将其输出存储在变量中：

WALLTIME=$(qstat -f $PBS_JOBID | sed -rn 's/.*Resource_List.walltime = (.*)/\1/p')

您还可以使用它来获取PBS_ *环境变量中没有的其他信息，例如为作业分配的内存量以及其他一些内容。