r function cor.test():如何计算皮尔逊相关的p值?

时间:2017-07-31 09:10:33

标签: r correlation pearson

这可能是一个非常简单的问题。

我无法在R中的cor.test()函数中找到pvalue计算背后的方法。

1 个答案:

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以下是计算Pearson相关性p值的代码:

x <- c(44.4, 45.9, 41.9, 53.3, 44.7, 44.1, 50.7, 45.2, 60.1)
y <- c( 2.6,  3.1,  2.5,  5.0,  3.6,  4.0,  5.2,  2.8,  3.8)
ct = cor.test(x, y, method = "pearson")
ct$p.value  ## this is what cor.test() gives

n <- length(x)
r <- cor(x, y)
df <- n - 2
t = sqrt(df) * r/sqrt(1 - r^2)
pval = 2 * min(pt(t, df), pt(t, df, lower.tail = FALSE))  ## this is calculated manually

ct$p.value == pval