PySpark:LogisticRegressionWithLBFGS在迭代中变得越来越慢

时间:2017-07-21 14:09:13

标签: apache-spark pyspark logistic-regression

我有一次迭代,它调用LogisticRegressionWithLBFGS x次。

问题是,每次循环迭代越来越慢,最终永远挂起。

我尝试了很多不同的方法,但到目前为止还没有运气。

代码如下:

def getBootsrapedAttribution( iNumberOfSamples, df):

    def parsePoint(line):
        return LabeledPoint(line[2], line[3:])

    aResults = {}
    while x <= iNumberOfSamples:
        print ("## Sample: " + str(x))
        a = datetime.datetime.now()
        dfSample = sampleData(df)
        dfSample.repartition(700)
        parsedData = dfSample.rdd.map(parsePoint)
        parsedData = parsedData.repartition(700)
        parsedData.persist()
        model = LogisticRegressionWithLBFGS.train(parsedData)
        parsedData.unpersist()
        b = datetime.datetime.now()
        print(b-a)
        x+=1

def sampleData(df):
    df = df.repartition(500)
    dfFalse = df.filter('col == 0').sample(False, 0.00035)
    dfTrue = df.filter('col == 1')
    dfSample = dfTrue.unionAll(dfFalse)
    return dfSample


getBootsrapedAttribution(50, df)

输出看起来像这样:

## Sample: 1
0:00:44.393886

## Sample: 2
0:00:28.403687

## Sample: 3
0:00:30.884087

## Sample: 4
0:00:33.523481

## Sample: 5
0:00:36.107836

## Sample: 6
0:00:37.077169

## Sample: 7
0:00:41.160941

## Sample: 8
0:00:54.768870

## Sample: 9
0:01:01.31139

## Sample: 10
0:00:59.326750

## Sample: 11
0:01:37.222967

## Sample: 12

...hangs forever

如果没有model = LogisticRegressionWithLBFGS.train(parsedData),它就会在没有性能问题的情况下运行。

我的群集如下所示:

spark.default.parallelism   500
spark.driver.maxResultSize  20G
spark.driver.memory 200G
spark.executor.cores    32
spark.executor.instances    2
spark.executor.memory   124G

有谁知道这个问题?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我回答了我自己的问题。

问题在方法LogisticRegressionWithLBFGS内。用LogisticRegression中的Spark 2.1+替换此方法解决了这个问题。每次迭代都不会减慢速度。

此外,您可以使用上述代码进行更多改进。 可以使用rdd方法sample替换DataFrame方法sampleBy。这也将避免不必要的union

.sampleBy('col', fractions={0: 0.00035, 1: 1}, seed=1234)

此外,上面代码中的所有repartitions都是不必要的。重要的是,传递给df的{​​{1}}分配得很好且getBootsrapedAttribution()