排序图 - 用不同颜色着色点

Question

我有一个包含9个站点和数千种物种的数据库。

我使用

创建了一个排序和一个情节

ord = metaMDS (vegan)
plot(ord, type ="n")
points(ord, display="species", col="grey")
text (ord, display="sites")

我得到了以下情节

我需要用红色获得一些物种点，如下图所示（忽略红点旁边的数字）

我在使用绘图功能之前已经完成了，但现在还不确定如何获得它。

任何帮助？

Answer 1

以下是一个示例，说明如何为某些选定的点指定红色。

library(vegan)

data(dune)
ord <- metaMDS(dune)
plot(ord, type ="n")

# Positions of red-colored points
red.pts <- c(2,3,4,5,10,15,20)
cols = rep("black",30)
cols[red.pts] <- "red"

points(ord, display="species", pch=20, cex=2, col=cols)
text(ord, display="sites")