滑动窗口分析产生的导入(部分)矩阵

时间:2017-06-05 13:08:38

标签: r

我现在有一个表格,其中有三列描述矩阵中的位置和统计关联值(特别是等位基因关联),所以:

x y z
1 2 0.1
1 3 0.2
2 3 0.4
2 4 0.1
3 4 0.2
......

矩阵缺少对角线值(没有计算值,比如位置(1,1),(2,2)或(3,3)。另外,因为这些值仅在小于在可能的x和y位置的整个范围内,得到的矩阵是不完整的。

我想要做的是将此表导入R,然后将其转换为矩阵,然后可以使用热图等方法进行汇总。鉴于矩阵标准向量到矩阵变换的滑动窗口性质似乎不是一种选择。任何关于如何做到这一点的建议将不胜感激。

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