DICOM体积数据的基础知识

Question

我已经查看了一些DICOM标准和维基百科页面（以及关于SO的所有DICOM主题）但是没有真正深入研究文件结构doc（ugh），我很遗憾完全存储在DICOM文件中，用于包含3D / 4D / 5D数据的扫描。我只想要一个概述。

我们以MRI为例。 DICOM文件是否包含

1. 从各种角度拍摄的一组原始2D图像
2. 形成3D体素数据集的一叠切片
3. 完整的3D数据集

换句话说，DICOM是否对成像机捕获的原始图像进行任何后处理？

就4D而言，可能只是一个多个3D数据集的集合，每个'框架'是一个单独的数据集？

Answer 1

DICOM“标准”中有许多不同的选项，以及供应商扩展，大多数事情都是可能的。

也就是说，我遇到的大多数3D DICOM数据集都是2D图像堆栈。对于后处理，它仅取决于成像机。

如果您正在寻找一个免费提供的DICOM库，您可以尝试GDCM，我对此非常满意。

Answer 2

原始DICOM MR格式包含单个2D图像。这种格式仍然得到广泛支持，很可能是你拥有的。如果 是您拥有的，那么您将需要收集系列中的所有图像来构建您的音量。

较新的增强型MR图像格式能够将整个体积存储为多帧图像。如果有，那就是你的音量。我不记得单个增强MR对象是否必须是整个系列。

您可以通过查看DICOM属性SOP类UID（0008,0016）来区分它们：

 Original MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4   
 Enhanced MR:  1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

上面，当我说您可能需要收集“系列中的所有图像”来构建卷时，这意味着您正在使用属性系列实例UID（0020,000E）共享相同值的图像）。

注意：

• DICOM纯粹主义者会更喜欢“图像信息对象定义”这个术语，而不是“格式”这个词，因为我一直在使用它。
• DICOM纯粹主义者反对说SOP类UID定义图像格式。为了您的目的，它将起作用。