在pygraphistry中可视化700万条边

时间:2017-05-24 15:04:29

标签: python-3.x pandas graph edge

我有大约700万边缘的大型数据集,在广泛搜索可视化这些数据的方法和工具之后,我遇到了pygraphistry我试图想象边缘和连接,而不是现在应用任何建模。但这显示没有错误没有超过6小时的输出

我的工作环境是python 3.x anaconda和windows 64 bit

    import pandas
    import graphistry

    #  "GRAPHISTRY_API_KEY".
    graphistry.register(key='key_from_team')

    column_names = ['node1', 'node2', 'StartTime', 'EndTime']
    logs = pandas.read_csv('Edges.dat', header = None, names = column_names )
    logs[:4] # Show the first three rows of the loaded dataframe

    '''
    logs['StartTime'] = pandas.to_datetime(logs['StartTime'], unit='s')
    logs['EndTime'] = pandas.to_datetime(logs['EndTime'], unit='s')
    logs[:4]
    '''

plotter = graphistry.bind(source='node1', destination='node2')
    plotter.plot(logs)

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