Question

我正在尝试实施tarjan的算法。我决定生成一个随机图，作为算法的输入，一次添加一个边。

我生成随机图并将其保存在文件中，如下所示

from networkx import *
import sys
import matplotlib.pyplot as plt

n = 10  # 10 nodes
m = 20  # 20 edges

G = gnm_random_graph(n, m)

# print the adjacency list to a file
try:
    nx.write_edgelist(G, "test.edgelist", delimiter=',')
except TypeError:
    print "Error in writing output to random_graph.txt"

fh = open("test.edgelist", 'rb')
G = nx.read_adjlist(fh)
fh.close()

我在test.edgelist文件中得到的输出是这样的。

0,4,{}
0,5,{}
0,6,{}
1,8,{}
1,3,{}
1,4,{}
1,7,{}
2,8,{}
2,3,{}
2,5,{}
3,8,{}
3,7,{}
4,8,{}
4,9,{}
5,8,{}
5,9,{}
5,7,{}
6,8,{}
6,7,{}
7,9,{}

然而，在我实施的tarjan算法中，输入的格式为

add_edge(1,2)
add_edge(2,3)
....

我希望在循环中使用随机生成的图形作为输入。

我怎么没有得到{}？此外，如果有更好的方法来实现这一点，请帮助，因为，对于大量数据集，它很难将其保存为单个列表（add_edge（）将边缘添加到列表中）

Answer 1

您必须将带有data参数的所有边数据拖放到False：

nx.write_edgelist(G, "test.edgelist", delimiter=',', data = False)

输出：

0,3
0,4
0,1
0,8
0,6
0,7

但是，如果您想以自己的格式保存边缘，请使用如下的循环：

from networkx import gnm_random_graph

n = 10  # 10 nodes
m = 20  # 20 edges

G = gnm_random_graph(n, m)

# iterate over all edges
with open('./test.edgelist', 'w') as f:
    for edge in G.edges():
        f.write("add_edge{0}\n".format(edge))

输出：

add_edge(0, 7)
add_edge(0, 4)
add_edge(0, 8)
add_edge(0, 3)
add_edge(0, 2)
add_edge(1, 5)
add_edge(1, 6)
add_edge(1, 7)
add_edge(2, 5)
add_edge(2, 4)
add_edge(2, 9)
add_edge(2, 8)
add_edge(2, 3)
add_edge(3, 9)
add_edge(3, 5)
add_edge(4, 9)
add_edge(4, 7)
add_edge(5, 9)
add_edge(6, 9)
add_edge(7, 9)

networkx中边缘列表的自定义输出

1 个答案: