将csv edgelist读入networkx

Question

我有一个格式为的数据集：

1,2

2,3

1,3

等。 （每对代表两个节点之间的边缘，例如'1,2'是节点1和节点2之间的边缘）

我需要将其读入networkx。目前我正在尝试将其作为列表读取，其中每对是列表中的一个元素，但这不起作用。

Answer 1

您可以使用networkx.read_edgelist（file，delimeter ='，'）。

e.g。

import StringIO
import networkx as nx
data = StringIO.StringIO("""1,2

2,3

1,3
""")

G = nx.read_edgelist(data, delimiter=',', nodetype=str)
for e in G.edges():
    print e
# ('1', '3')
# ('1', '2')
# ('3', '2')