阅读巨大的边缘列表并在NetworkX中绘制它

时间:2013-06-13 04:40:32

标签: python matplotlib networkx

我有一个名为Reed98.edgelist的巨大边缘列表。我使用networkx读取并将其绘制为图形。出现此错误:

C:\Python26\lib\site-packages\networkx-1.7-py2.6.egg\networkx\drawing\layout.py:369: DeprecationWarning: functions overriding warnings.showwarning() must support the 'line' argument
  pos+=(displacement*t/length).T
C:\Python26\lib\site-packages\networkx-1.7-py2.6.egg\networkx\drawing\layout.py:514: DeprecationWarning: functions overriding warnings.showwarning() must support the 'line' argument
  pos[:,i]*=scale/lim

我的代码:

import networkx as nx
import pylab as plt

G=nx.read_edgelist('Reed98.edgelist')
nx.draw(G)
plt.show()

使用样本边缘列表,如:

0   2
0   3
0   5
0   9
0   602
0   11
1   443
1   445
1   456
1   463
1   478
2   134
2   136
2   9
2   10
.......
.......

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

文件“Reed98.edgelist”或networkx的安装必须是其他错误。我会先验证简单的图表是否按预期工作。当我使用您的示例数据集尝试上述完全时,我得到了一个工作图:

enter image description here