线性混合效果模型没有在R中完成。
我使用包lmekin来运行模型，因为我将亲属矩阵作为随机效果拟合。我使用的公式是：
模型＆lt; - lmekin（疾病〜分数+年龄+（1 | IID），数据=表型_df， varlist中= kinship_mx）
phenotype_df是一个数据框，有12000个人，每个人都有疾病状态（1或0），分数和他们的年龄。 （注意：我在这里将疾病状态视为定量）。
kinship_mx是亲属矩阵，即。一个正定矩阵（12000x12000），对角线〜0.5。
当我使用~1000个人时，这个模型在大约1分钟内运行。但是，我让模型在我们的大型服务器上与所有12000个人一起运行，并且在5天后还没有完成。任何人都可以提出一个理由，为什么会发生这种情况，以及是否有任何解决方案可以使模型完成？
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回答这个问题 - 他们在三周后结束了。这需要很长时间。