lmfit在拟合后提取拟合统计参数

时间:2017-04-13 00:48:37

标签: python curve-fitting lmfit

这是关于从lmfit fit_report()1)对象中提取适合统计信息的问题

this lmfit示例中,返回以下部分输出:

[[Model]]
    Model(gaussian)
[[Fit Statistics]]
    # function evals   = 31
    # data points      = 101
    # variables        = 3
    chi-square         = 3.409
    reduced chi-square = 0.035
    Akaike info crit   = -336.264
    Bayesian info crit = -328.418
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我正在尝试将Fit Statistics部分中的所有数量提取为单独的变量。

例如。要提取模型参数,我们可以使用(12):

for key in fit.params:
    print(key, "=", fit.params[key].value, "+/-", fit.params[key].stderr)

但是,这只给出了模型参数;它没有给出拟合统计参数,这也是有用的。我似乎无法在文档中找到它。

是否有类似的方法分别提取 Fit Statistics 参数(chi-squarereduced chi-squarefunction evals等)?

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

结果包含所有拟合统计数据。您可以获得所需的参数,如下所示

result = gmodel.fit(y, x=x, amp=5, cen=5, wid=1)
# print number of function efvals
print result.nfev
# print number of data points
print result.ndata
# print number of variables
print result.nvarys
# chi-sqr
print result.chisqr
# reduce chi-sqr
print result.redchi
#Akaike info crit
print result.aic
#Bayesian info crit
print result.bic

答案 1 :(得分:2)

是的,抱歉,在{0.9}版本中无意中关闭了Model.fit_report()中适合统计信息的报告。这是在主github仓库中修复的。

正如user1753919所示,您可以获得这些单独的值。 ModelResult的这些属性记录在https://lmfit.github.io/lmfit-py/model.html#modelresult-attributes