在numpy数组中有效计算零元素?

时间:2017-03-21 00:22:09

标签: python arrays performance numpy multidimensional-array

我需要计算numpy数组中零元素的数量。我知道numpy.count_nonzero函数,但似乎没有用于计算零元素的模拟函数。

我的数组不是很大(通常小于1E5元素),但操作执行了数百万次。

当然我可以使用len(arr) - np.count_nonzero(arr),但我想知道是否有更有效的方法。

这是我目前如何做的MWE:

import numpy as np
import timeit

arrs = []
for _ in range(1000):
    arrs.append(np.random.randint(-5, 5, 10000))


def func1():
    for arr in arrs:
        zero_els = len(arr) - np.count_nonzero(arr)


print(timeit.timeit(func1, number=10))

1 个答案:

答案 0 :(得分:22)

更快一点的方法是使用np.count_nonzero(),但根据需要使用条件。

In [3]: arr
Out[3]: 
array([[1, 2, 0, 3],
      [3, 9, 0, 4]])

In [4]: np.count_nonzero(arr==0)
Out[4]: 2

In [5]:def func_cnt():
            for arr in arrs:
                zero_els = np.count_nonzero(arr==0)
                # here, it counts the frequency of zeroes actually

您也可以使用np.where,但速度比np.count_nonzero()

In [6]: np.where( arr == 0)
Out[6]: (array([0, 1]), array([2, 2]))

In [7]: len(np.where( arr == 0))
Out[7]: 2

效率:(按降序排列)

In [8]: %timeit func_cnt()
10 loops, best of 3: 29.2 ms per loop

In [9]: %timeit func1()
10 loops, best of 3: 46.5 ms per loop

In [10]: %timeit func_where()
10 loops, best of 3: 61.2 ms per loop