R：igraph，graph.data.frame错误＆＃34;边列表中的一些顶点名称未在顶点数据框中列出＆＃34;

Question

我正在尝试将属性分配给网络中的顶点。我正在使用的代码是：

g2 <- graph.data.frame(edgelist2014, vertices=nodelabels2014, directed=FALSE)

其中edgelist2014是一个边缘列表，其格式为514,000 +：

fromRespondent  toRespondent   weight
1                2             6
1                3             4
...              ...           ...    
1014             1015          7

和nodelabels2014是一个数据框，其中第一列为fromRespondent，列出1 - 1015，后跟14列属性数据。我也试过1 - 1014.

我以多种不同方式运行代码并不断收到错误：

Some vertex names in edge list are not listed in vertex data frame. 

我知道所有观察都匹配，因为我在Stata中运行了合并功能，并且每个观察都来自edgelist2014和nodelabels2014。请让我知道我做错了什么。

Answer 1

我已经遇到了这个问题，并通过提出以下建议解决了该问题：

首先，尝试分别在网络的传出和传入变量中分别插入非数字字符，分别称为“ fromRespondent”和“ toRespondent”。插入s01，s02，s03，...，而不是1、2、3，...

如果错误仍然存​​在，请检查您的数据集“ edgelist2014”和“ nodelabels2014”是否一致。例如，在“ nodelabels2014”中查找作为在“ edgelist2014”中形成的边的所有相应顶点。

由于“ edgelist2014”数据集包含约514,000个示例，因此对于“ fromRespondent”和“ toRespondent”列，如果缺少某些内容，并且在“ nodelabels2014”中存在这些元素中的每个元素，则实现验证会更加成功“数据集。

Answer 2

我有同样的问题，它似乎不适用于非数字数据。我想制作一个显示演员联系的 igraph。

nodes <- read.csv("D1-NODES.csv", header=T, as.is=T)
links <- read.csv("D1-EDGES.csv", header=T, as.is=T)

数据

# Producing the igraph

net <- graph_from_data_frame(d=links, vertices=nodes, directed=T)
#create a layout for plot
l <- layout_nicely(net2)
p1 <- plot(net2, edge.arrow.size= 0.5, edge.curved= 0.2, vertex.color=nodes$Inter.type, rescale=5, frame= T,vertex.label.cex=1.4, vertex.size=20, vertex.label.color="black",edge.lty= 2, vertex.frame.color= "gray", layout=l )

我收到此错误消息：

<块引用>

边列表中的某些顶点名称未在顶点数据框中列出