Question

我有一个非常大的矩阵，它是一个视频文件，作为一个帧数组，每个帧的分辨率约为350x250。我在一个视频文件中有大约8,000-10,000个这样的帧，大小约为1-1.5GB。我认为HDF5是一个很好的文件格式供我使用，因为我必须对文件执行大量的数学运算（在整个深度列上）。我的问题是我无法将这个3D矩阵存储在HDF5中。有人可以建议我如何以增量方式存储这些帧（逐帧添加到hdf5文件）作为hdf5格式的3D矩阵？我正在使用h5py python包。

Answer 1

举个例子，我们假设您的视频有10帧，分辨率为200x200像素。因此，您必须使用数据类型uint8（每个RGB组件使用8个无符号位）创建尺寸为10 x 200 x 200 x 3的数据集。这是如何转移到h5py api。查看docs了解详情。

import h5py
import numpy as np

# create an hdf5 file
with h5py.File("/tmp/videos.h5") as f:
    # create a dataset for your movie
    dst = f.create_dataset("myvideo", shape=(10, 200, 200, 3),
                           dtype=np.uint8)
    # fill the 10 frames with a random image
    for frame in range(10):
        dst[frame] = np.random.randint(255, size=(200, 200, 3))

如何以HDF5格式存储非常大的三维矩阵？

1 个答案: