绘制微阵列探针

时间:2017-01-31 05:41:10

标签: bioinformatics bioconductor

我已经分析了一些漂浮了几年的微阵列数据。然后我在Limma输出文件中注意到有许多探针,其基因ID与任何已知数据库中的基因ID不同。我已经设法从安捷伦获得探针序列,但我有问题将它们分配给基因组中的基因。 我没有探针的坐标,所以我需要先将它们映射出来。您是否知道任何Bioconductor包将采用fasta格式的探针并使用基因组的gff文件或gbk输出它们所在的基因?我正在使用 Acaryochloris marina

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