如何在simper函数中指定治疗

时间:2016-11-14 21:30:42

标签: r function

我想做一个更简单的测试,用于两个有两种不同处理的社区之间的比较.Ddata矩阵包含植物物种作为列和行是Year_Replication_Fertilizer(因为这是一个多年的复制研究和两种肥料处理)。我需要知道如何在simper函数中指定处理。

我使用了这段代码:

test<-read.csv("Fertilizer.csv")  #Remove site names
m<-as.matrix(test[,-1]) #Use site names as row names 
row.names(m)<- test[,1]  #install.packages("reshape2")
#install.packages("ggplot2") 
library(vegan) 
library(reshape2) 
library(ggplot2)  
simpcom<- simper(comm=m, group=m$Group).

在原始数据框中,列包含处理,年份称为组。但我想我用我给出的代码删除了该组。在siper测试中,需要在治疗之间和之间进行比较,以查看社区的最大贡献者以及他们彼此之间的差异。请帮助我在我发送的代码的最后一行中如何做到这一点。

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