使用ANOSIM和SIMPER在R中的不同结果

Question

我已经运行ANOSIM和SIMPER来分析两种治疗方法的社区相似性。

当我运行ANOSIM时，输出为：

ANOSIM统计R：-0.04465       意义：0.749

意味着它们彼此相似？

但我运行SIMPER它说两种治疗方法的成分相互之间有62％不同？

不确定如何解释两个测试的输出......他们为什么说不同的东西？

Answer 1

我查了一下文档。

1. 他们彼此相似吗？是的：

  

选择除数使得R将在-1 ... + 1的值区间内   0表示完全随机分组。

1. 62％是否意味着这些群体彼此不同？不，需要超过70％。

   该功能为每对组显示最重要的物种。这些物种至少占组间差异的70％。

2. 还有这个说明：

  

simper的结果可能很难解释。方法   非常糟糕地混淆了群体差异和内部差异   群体变异，似乎挑出可变物种而不是   独特的物种（Warton等，2012）。即使你组成团体   是相互的副本，该方法将挑出高的物种   贡献，但这些不是对不存在的贡献   组间差异，但组内变异   丰度。