Question

这可能是一个非常简单的问题，但如果我有工作ID，我如何获得通过SGE提交的工作状态？我基本上想检查一个工作ID，看看它是否处于错误状态，它是否仍然在运行，或者它已经完成。

我在想这样的事情

qstat -j '123456'

但是如果作业ID很低，它可能会返回除我想要的行以外的行。并使用这样的命令...

{{1}}

...似乎没有返回工作状态。

Answer 1

发出命令：

qstat -xml

结果将采用XML格式。您可以解析结果并提取状态：

<job_list state="pending">
  <JB_job_number>3150728</JB_job_number>
  <JAT_prio>0.00000</JAT_prio>
  <JB_name>snpReference</JB_name>
  <JB_owner>me</JB_owner>
  <state>hqw</state>
  <JB_submission_time>2016-11-23T11:54:01</JB_submission_time>
  <queue_name></queue_name>
  <jclass_name></jclass_name>
  <slots>1</slots>
</job_list>

Answer 2

我已迁移到Torque / Maui，因此GridEngine的解决方案可能不准确。

使用qstat和grep尝试使用基于字词的搜索：

qstat -u '*' | grep -w 123456

或者，使用awk

qstat -u '*' | awk '$1 == 123456 { print }'

对于Toque / Maui，我可以使用qstat -f $jobid获取作业状态：

qstat -f 123456 | grep job_state

也许您可以使用-j选项执行类似操作：

qstat -j $job_id | grep job_state

Answer 3

让你的正则表达式更具体：

qstat | grep "^123456\s"

这样你只会获得整个工作号码是你指定的工作。

如何获得SGE工作状态

3 个答案: