将SGE作业提交给PBS / Torque

Question

您好我正在建立一个软件管道（一个广泛的生物信息学注释工具），最初是为了提交SGE工作而写的，但我在PBS / Torque集群上。有关将这些脚本从SGE转换为PBS的方法的任何想法？或者是一个可以向PBS提交SGE工作的软件？

谢谢，马库斯

Answer 1

在网上搜索发现：

http://wiki.ibest.uidaho.edu/help/Tutorials/SGE_PBS_Converting.html

使用上面链接中的表创建替换的脚本很简单，如果不是那么乏味。

Answer 2

以下是Torque和SGE命令的有用并排比较： https://kb.iu.edu/d/avgl

我不知道任何会自动转换脚本的工具，因为在某些方面，这两个系统可能完全不同（例如，它们以不同方式处理并行环境等）。