如何使用等于零的行过滤基因表达数据集？

Question

我想删除表达式数据集中的行，这些行的值总共为零，我搜索并找到下面的代码我不确定它的工作原理是什么人能解释我[(3:col(df))]]==0)==col(df)-2, ]这个论点是什么装置

df[ !(df[rownames(df),[(3:col(df))]]==0)==col(df)-2, ]

Answer 1

这是一种笨重的代码，似乎有点乱码。

df[rowSums(df[,3:ncol(df)]==0)!=ncol(df)-2,]

将选择数据帧的行，其中列的最后一个（ncol-2）不是全为零。

• df[,3:ncol(df)]选择除前两列以外的所有列
• rowSums(.==0)计算每行中的零数
对于零的数量不等于（剩余）列数的所有条目，
• . != ncol(df)-2为TRUE
• df[.,]选择行

稍微简单的替代方案是

df[any(df[,-(1:2)]!=0),]