检查panadas数据帧的奇异矩阵

时间:2016-10-16 01:56:58

标签: python pandas

我正在尝试使用pandas scatter_matrix来显示数据帧内容,例如:

scatter_matrix(df, alpha=0.2, figsize=(6, 6), diagonal='kde')

然而,我得到一个奇异的矩阵错误,因为带有kde选项代码的scatter_matrix试图反转没有协方差的数据的协方差矩阵。

#see pands.tools.plotting.scatter_matrix
n = df.columns.size
mask = notnull(df)
for i, a in zip(range(n), df.columns):
    for j, b in zip(range(n), df.columns):
        if i == j:
            values = df[a].values[mask[a].values]
            from scipy.stats import gaussian_kde
            y = values
            try:
                #the line below calls linalg.inv(self._data_covariance)
                #which throws the LinAlgError
                gkde = gaussian_kde(y)
            except LinAlgError as e:
                logger.debug("Error, data: {0}".format(y))

有没有办法可以重新创建数据框,以便删除没有协方差的矩阵组合?

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