用c ++调用lapack和blas

时间:2016-10-11 18:27:28

标签: c++ lapack blas

我需要在我的c ++代码中使用lapack和blas,我想在linux系统中链接MKL,ACML或默认的lapack和blas。不幸的是,他们在c中有不同的惯例。例如,MKL(mkl_blas.h)中的zdotc是

zdotc(&result, &n, x, &incx, y, &incy);

从默认的lapack调用zdotc,blas(fortran版本)是:

result = zdotc_(&n, x, &incx, y, &incy);

如果我希望我的代码使用MKL,ACML或默认的lapack blas。我需要为此写一个包装:

#ifdef FORTRAN_NO_UNDERSCORE
    #define F77NAME(x) x
#else
    #define F77NAME(x) x##_
#endif

complex<double> zdotc_wrap(int n, const complex<double>*x, int incx, const complex<double>*y, int incy) 
{
  #if defined(USE_MKL)
    complex<double> result;
    zdotc(&result, &n, x, &incx, y, &incy)
    return result;
  #elif defined(USE_LAPACK_BLAS)
    return F77NAME(zdotc)(&n, x, &incx, y, &incy);
  #elif defined(USE_ACML)
    ...
  #endif
}

虽然功能太多,但为每个功能编写包装需要花费时间。我希望它们有一个独特的惯例。如果你在代码中使用lapack和blas,你如何解决这个问题?你有所有功能的包装吗?如果有一个包装,如果你可以和我分享它会很棒。

更新

我找到了解决这个问题的方法之一:

#ifndef FORTRAN_COMPLEX_FUNCTIONS_RETURN_VOID
extern complex<double> zdotc(
#else
extern void zdotc(complex<double>* retval,
#endif
    const int *n,
    const complex<double> *zx,
    const int *incx,
    const complex<double> *zy,
    const int *incy
);

然后我可以通过以下方式调用此函数:

complex<double> result;
#ifndef FORTRAN_COMPLEX_FUNCTIONS_RETURN_VOID
result = zdotc(
#else
zdotc(&result,
#endif
&n, x, &incx, y, &incy);

有什么建议吗?好的解决方案谢谢你的帮助。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

供应商提供的BLAS和LAPACK实现通常包含具有尾随下划线的符号,因为这是Fortran 77编译器最初工作的方式。现代gfortran行为也是为兼容性添加了尾随下划线,但有-fno-underscoring option可以将其关闭。

对于使用gfortran编译的代码,例如参考BLAS和LAPACK,您可以选择是直接返回复杂值还是使用间接result指针参数。要获得间接行为,请使用-ff2c进行编译。默认的gfortran行为是直接返回复杂值。

避免代码中宏和包装的最简单方法是在名称中使用尾随下划线,并在添加的第一个参数中假设复杂结果的间接返回值。这将与供应商库兼容。然后使用-ff2c编译BLAS和LAPACK以使其在那里工作。

为了获得最大的灵活性,您可以使用环绕功能。在包装器中,您只需要担心是否直接返回复杂的参数,您不需要为每个不同的库进行特殊处理。

complex<double> zdotc_wrap(int n, const complex<double>*x, int incx, const complex<double>*y, int incy) 
{
  #if defined(FORTRAN_COMPLEX_FUNCTIONS_RETURN_VOID)
    complex<double> result;
    zdotc_(&result, &n, x, &incx, y, &incy);
    return result;
  #else
    return zdotc_(&n, x, &incx, y, &incy);
  #endif
}

在BLAS中,只需要包含少量函数:CDOTU CDOTC ZDOTU ZDOTC。在LAPACK中只有CLADIV ZLADIV(我认为)。

答案 1 :(得分:0)

我在我的c ++代码中使用lapack而我还没有遇到过这个问题。您可以查看cosmo++库。查看source / matrix_impl.cpp文件。我有一个extern "C"块,其中包含我需要的函数,以_结尾。我已经针对lapack / blas以及MKL编译了这段代码而没有任何问题。我使用过gcc和intel编译器。它还使用framework Accelerate在我的Mac上编译。