使用多个数据集进行Procrustes分析

Question

我对社区对环境梯度的反应很感兴趣。我有4个不同群体（无脊椎动物，硅藻，水生植物和鱼类）的物种数据（丰度）。我还有一套环境描述符（溪流和集水区的物理化学参数）。我有10个流的所有这些信息。

我想计算一个Procrustes分析，看看这些组是否以相同的方式响应环境梯度。我在环境描述符上运行了不同的RDAs（每组1个RDA）和PCA。理想情况下，我想在我的4个RDAs和1个PCA之间运行Procrustes分析（即总共5个配置）。但是，纯素包中的procrustes功能只允许使用2种配置......

在同一分析中有没有办法解决这5种配置？

Answer 1

您需要广义 Procrustes分析。它似乎至少在以下 R 包中可用：形状， factoMiner ， EvoMorph ，显然在几个其他

或者您可以考虑使用INDSCAL：查看 R 包 smacof ，多路， sensoMiner 以及您搜索到的其他人 R 包列表。