如何计算这个巨大的相关矩阵?

时间:2016-08-30 20:54:24

标签: r matrix ff pearson bigdata

我有一个巨大的矩阵,其中nrow = 144,ncol = 156267包含数字,我想计算所有列之间的相关性。这可以使用此处描述的bigcor函数完成:https://www.r-bloggers.com/bigcor-large-correlation-matrices-in-r/

在我运行bigcor函数之后:

bigcor(Mbig2, nblocks = 1611, verbose = TRUE)

这会导致以下错误:

  

if(length< 0 || length> .Machine $ integer.max)中的错误停止("长度必须介于1和.Machine $ integer.max&#34之间):     缺少需要TRUE / FALSE的值   另外:警告信息:   在ff(vmode ="单",dim = c(NCOL,NCOL)):

我的问题是:1)这是否可行?有没有办法逃避错误?

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