如何使用python计算巨大矩阵中的Spearman相关性?

时间:2018-08-01 01:56:07

标签: python correlation

我有一个大矩阵,其中包括41717行×1000列。我想计算p值矩阵之间的Spearman相关性。然后我可以得到41717 * 41717的相关矩阵。但是花费了这么长时间,jupyter笔记本内核死了。那么有什么方法可以解决这个问题?

rho, pval = scipy.stats.spearmanr(df)

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