Fortran:阅读输入

时间:2016-08-09 21:58:20

标签: input fortran intel-fortran

我正在尝试运行一个非常大的FORTRAN模型,所以我无法提供所有涉及的代码,但我希望我能提供足够的信息来理解这一点。 编译好的代码(使用Intel 2016.0.109编译器,OpenMPI 1.10.2和HDF5 1.8.17)。

当我尝试运行它时,它告诉我我的两个输入(称为NZG和NZS)设置为-999,因此失败。

> >>>>  opspec_grid  error! in your namelist!
>     ---> Reason:      Too few soil layers.  Set it to at least 2. Your nzg is currently set to -999...
>     ---> Reason:      Too few maximum # of snow layers. Set it to at least 1.  Your nzs is currently set to -999.

但是,在输入文件中,它们实际上被指定为

   NL%NZG  = 9
   NL%NZS  = 1

我浏览了所有与这些变量有某些关系的模块,并且找不到任何应该脱轨的地方。 所以我现在开始思考,读取值的方式可能有问题。输入文件是一个文本文件。变量在模块中指定为整数,读取它们,FYI。 我应该检查特殊字符还是什么?我知道Fortran可以挑剔输入......

编辑:在代码序列下面追溯错误

1)主模块打开名单

write (unit=*,fmt='(a)') 'Reading namelist information'
call read_nl(trim(name_name))

read_nl

subroutine read_nl(namelist_name)
   use ename_coms, only : nl              & ! intent(inout)
                        , init_ename_vars ! ! subroutine

   implicit none
   !----- Arguments. ----------------------------------------------------------------------!
   character(len=*), intent(in) :: namelist_name
   !----- Local variables. ----------------------------------------------------------------!
   logical                      :: fexists
   !----- Name lists. ---------------------------------------------------------------------!
   namelist /ED_NL/ nl
   !---------------------------------------------------------------------------------------!

   !----- Open the namelist file. ---------------------------------------------------------!
   inquire (file=trim(namelist_name),exist=fexists)
   if (.not. fexists) then
      call fatal_error('The namelist file '//trim(namelist_name)//' is missing.'           &
                      ,'read_nl','ed_load_namelist.f90')
   end if

   !----- Initialise the name list with absurd, undefined values. -------------------------!
   call init_ename_vars(nl) 

   !----- Read grid point and options information from the namelist. ----------------------!
   open (unit=10, status='OLD', file=namelist_name)
   read (unit=10, nml=ED_NL)
   close(unit=10)

   return
end subroutine read_nl

2)然后有关于如何(从什么变量)读取名单(输入)

的细节
write (unit=*,fmt='(a)') 'Copying namelist'
call copy_nl('ALL_CASES')  

if (runtype == 'HISTORY') then
  call copy_nl('HISTORY')
else
  call copy_nl('NOT_HISTORY')
end if

我的模拟是'NOT_HISTORY'copy_nl('ALL_CASES')被指定,因此它读取了许多名单变量,包括变量'runtype' - 然后在if-else语句中使用。

3)然后copy_nl('NOT_HISTORY')如下,这是定义nzg和nzs的地方。

subroutine copy_nl(copy_type)
use grid_coms            , only : time                      & ! intent(out)
                                   , centlon                   & ! intent(out)
                                   , centlat                   & ! intent(out)
                                   , deltax                    & ! intent(out)
                                   , deltay                    & ! intent(out)
                                   , nnxp                      & ! intent(out)
                                   , nnyp                      & ! intent(out)
                                   , nstratx                   & ! intent(out)
                                   , nstraty                   & ! intent(out)
                                   , polelat                   & ! intent(out)
                                   , polelon                   & ! intent(out)
                                   , ngrids                    & ! intent(out)
                                   , timmax                    & ! intent(out)
                                   , time                      & ! intent(out)
                                   , nzg                       & ! intent(out)
                                   , nzs                       ! ! intent(out)
implicit none
   !----- Arguments. ----------------------------------------------------------------------!
   character(len=*), intent(in) :: copy_type
   !----- Internal variables. -------------------------------------------------------------!
   integer                      :: ifm
   !---------------------------------------------------------------------------------------!

   !---------------------------------------------------------------------------------------!
   !     Here we decide which variables we should copy based on the input variable.        !
   !---------------------------------------------------------------------------------------!
select case (trim(copy_type))
case ('NOT_HISTORY')

  itimea        = nl%itimea
  idatea        = nl%idatea
  imontha       = nl%imontha
  iyeara        = nl%iyeara

  nzg           = nl%nzg
  nzs           = nl%nzs

  slz(1:nzgmax) = nl%slz(1:nzgmax)

  current_time%year  = iyeara
  current_time%month = imontha
  current_time%date  = idatea
  current_time%time  = real(int(real(itimea) * 0.01)) * hr_sec                         &
                     + (real(itimea) * 0.01 - real(int(real(itimea)*0.01)))            &
                     * 100.0 * min_sec
  time               = 0.0d0

请注意,我没有将所有模块和变量放在use中,否则这篇文章会变得非常长。 仅供参考模块grid_coms指定变量的类型。请参阅下面的相关部分(整个模块是变量列表,没有别的)

module grid_coms
  integer :: nzg                            ! Number of soil levels
  integer :: nzs                            ! Number of snow/surface water levels
end module grid_coms

4)回到主模块,然后调用ed_opspec_grid来检查变量是否有意义,这就是出错的地方。再次,use变量在开始时被初始化,我将其留在这里。

subroutine ed_opspec_grid
!---------------------------------------------------------------------------------------!
   !      Check whether soil layers are reasonable, i.e, enough layers, sorted from the !
   ! deepest to the shallowest.                                                            !
   !---------------------------------------------------------------------------------------!
   if (nzg < 2) then
      write (reason,'(a,1x,i4,a)')                                                         &
            'Too few soil layers.  Set it to at least 2. Your nzg is currently set to'     &
           ,nzg,'...'
      call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
      ifaterr=ifaterr+1        
   elseif (nzg > nzgmax) then 
      write (reason,'(2(a,1x,i5,a))')                                                      &
            'The number of soil layers cannot be greater than ',nzgmax,'.'                 &
           ,' Your nzg is currently set to',nzg,'.'
      call opspec_fatal(reason,'opspec_grid') 
      ifaterr=ifaterr+1 
   end if
   do k=1,nzg
      if (slz(k) > -.001) then
         write (reason,'(a,1x,i4,1x,a,1x,es14.7,a)')                                       &
               'Your soil level #',k,'is not enough below ground. It is currently set to'  &
               ,slz(k),', make it deeper than -0.001...'
         call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
         ifaterr=ifaterr+1        
      end if
   end do

   do k=1,nzg-1
      if (slz(k)-slz(k+1) > .001) then
         write (reason,'(2(a,1x,i4,1x),a,2x,a,1x,es14.7,1x,a,1x,es14.7,a)')                &
               'Soil layers #',k,'and',k+1,'are not enough apart (i.e. > 0.001).'          &
              ,'They are currently set as ',slz(k),'and',slz(k+1),'...'
         call opspec_fatal(reason,'opspec_grid')  
         ifaterr=ifaterr+1        
      end if
   end do
end subroutine ed_opspec_grid

请注意,这不是此子程序中的第一次检查。在此部分之前检查其他变量(我将其留下),但这是第一条错误消息。这让我觉得可能是输入的一部分是好的,有些则不是。

最后,让我再次强调这是一个非常大的项目,我真的无法显示所有代码,这就是为什么我非常简单地解决了这个问题:是否有任何(文本)输入要求我可能错过了Fortran (特殊字符,返回,对于不同的系统可能不同?)。 此外,许多研究人员在不同的平台上使用此代码,所以我很怀疑代码本身是否存在问题...(但是,如果我错了,请告诉我。)

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您没有向我们提供足够的数据来查明问题,因此我只会告诉您使用名单时遇到的两个问题:

  1. 如果您从同一个文件中读取多个(甚至不同的)名单,则订单计数:如果在文件名列表中a位于名称列表b之前,则代码为{{1}首先,除非你回卷文件,否则它将找不到b

  2. 如果数据文件中的名称列表不包含一个或多个值,则这些值将保持不变。很可能在代码中这些变量被专门设置为a,以便注意它们的缺失。因此请仔细检查数据文件是否正确。查找可能过早结束名单的迷路-999个字符

  3. 总而言之,为了正确评估正在发生的事情,我们至少需要3件事:

    1. 声明块,包括构成此名称列表一部分的所有变量,以及/规范

    2. 声明此特定名称列表的名单文件部分,

    3. 是否有任何其他名单也在同一个文件中,以及它们是在此名称列表之前还是之后(包括在文件和代码中)