ELKI GUI没有用于分层聚类的聚类结果

Question

我是ELKI的新手，我需要对我已经在Weka中测试和聚类的数据集进行一些基本的聚类。我正在使用＆＃34; GUI版本＆＃34;我读了教程分析＆＃34;鼠标＆＃34; ELKI网站上的数据集：http://elki.dbs.ifi.lmu.de/wiki/Tutorial#Analyzingthemousedataset

我使用EM聚集了我的数据集并成功可视化并输出结果（从教程我刚刚更改了参数 resultHandler：ResultWriter ）。我在文件夹中得到的结果是：cluster.txt，cluster-evaluation.txt和settings.txt。

我对分层算法（SLINK，CLINK等）的输出结果有疑问。我得到的输出只是settings.txt，但我需要cluster.txt。

我需要更改其他一些参数，因为在日志视图中没有错误？

Answer 1

要从层次聚类结果中获取分区，还需要指定聚类提取方法：

-algorithm clustering.hierarchical.extraction.HDBSCANHierarchyExtraction
-algorithm CLINK
-hdbscan.minclsize 50

请注意，我们现在有两个 -algorithm参数，订单非常重要。提取算法有一个＆＃34;嵌套＆＃34;算法调用实际的层次聚类。

从长远来看，我们希望转向基于操作员的方法（特别是对于GUI）。对于命令行，嵌套调用更安全，因为您无法在不运行分层聚类的情况下提取。

对于CLINK，群集质量通常不太好（它还依赖于顺序，因此对数据进行混洗并多次运行会产生不同的结果）。我也试着给AGNES或Anderberg一个完整的联系; AGNES总是O（n ^ 3），Anderberg通常在O（n ^ 2）（只有最坏的情况是O（n ^ 3））并且两者都产生更好的结果（除了绑定之外，它们预计产生相同的结果距离，CLINK是不同的）：