使用ELKI源代码进行分层聚类

Question

我尝试使用ELKI（用于开发索引结构支持的KDD应用程序的环境）进行分层聚类。所以几天前，我导入了ELKI源代码（Maven项目），然后运行了miniGUI。

我的问题是：

1. 我想将ResultVisulizer用于结果。但是，我发现resulthandler中没有ResultVisulizer项。如何在此处列出此ResultVisulizer项目？

2. 我想看看层次聚类的树形图。为此目的，需要在此miniGUI中设置哪些参数？

Answer 1

1. 要启用SVG可视化工具，请启用svg maven 配置文件。 SVG增加了大约17 MB的依赖项，因此我们决定将其作为可选模块。

2. ELKI目前没有树形图可视化，因为这种可视化不是很容易扩展;有超过几十个实例，他们变得难以阅读。此外，在许多有趣的数据集上，距离（高度）太相似，所以不幸的是，树状图再次不是很有用。

   如果提取群集并简化层次结构，ELKI将显示群集层次结构树，但不会使用高度信息（出于上述原因，并且出于可读性原因）。 ELKI具有强大的分层聚类的聚类提取方法，这些方法在R中是不可用的。

   欢迎您提供树状图可视化;但请尽量使其对广泛的用户群有用，而无需过多的自定义。

以下是R (Source)的一个例子，说明为什么我不相信树状图（以及为什么它在我的个人优先列表中很低 - 其他人必须将此贡献给ELKI）：