我已经阅读了这个question的答案,他们非常有帮助,但我需要特别是在R的帮助。
我在R中有一个示例数据集,如下所示:
x <- c(32,64,96,118,126,144,152.5,158)
y <- c(99.5,104.8,108.5,100,86,64,35.3,15)
我想为这些数据拟合模型,以便y = f(x)
。我希望它是一个三阶多项式模型。
我怎样才能在R中这样做?
另外,R可以帮我找到最合适的模型吗?
答案 0 :(得分:86)
要获得x(x ^ 3)中的三阶多项式,可以执行
lm(y ~ x + I(x^2) + I(x^3))
或
lm(y ~ poly(x, 3, raw=TRUE))
你可以拟合10阶多项式并得到近乎完美的拟合,但是你应该吗?
编辑: poly(x,3)可能是更好的选择(参见下面的@hadley)。
答案 1 :(得分:40)
哪种模式是“最佳拟合模型”取决于“最佳”的含义。 R有工具可以提供帮助,但您需要提供“最佳”的定义,以便在它们之间进行选择。请考虑以下示例数据和代码:
x <- 1:10
y <- x + c(-0.5,0.5)
plot(x,y, xlim=c(0,11), ylim=c(-1,12))
fit1 <- lm( y~offset(x) -1 )
fit2 <- lm( y~x )
fit3 <- lm( y~poly(x,3) )
fit4 <- lm( y~poly(x,9) )
library(splines)
fit5 <- lm( y~ns(x, 3) )
fit6 <- lm( y~ns(x, 9) )
fit7 <- lm( y ~ x + cos(x*pi) )
xx <- seq(0,11, length.out=250)
lines(xx, predict(fit1, data.frame(x=xx)), col='blue')
lines(xx, predict(fit2, data.frame(x=xx)), col='green')
lines(xx, predict(fit3, data.frame(x=xx)), col='red')
lines(xx, predict(fit4, data.frame(x=xx)), col='purple')
lines(xx, predict(fit5, data.frame(x=xx)), col='orange')
lines(xx, predict(fit6, data.frame(x=xx)), col='grey')
lines(xx, predict(fit7, data.frame(x=xx)), col='black')
哪种型号最好?可以为它们中的任何一个做出参数(但我不想使用紫色的那个进行插值)。
答案 2 :(得分:14)
关于'可以帮助我找到最合适的模型'的问题,可能有一个函数可以做到这一点,假设您可以说明要测试的模型集,但这对于该集合来说这将是一个很好的第一种方法。 n-1次多项式:
polyfit <- function(i) x <- AIC(lm(y~poly(x,i)))
as.integer(optimize(polyfit,interval = c(1,length(x)-1))$minimum)
备注
此方法的有效性取决于您的目标,optimize()
和AIC()
的假设以及AIC是您要使用的标准,
polyfit()
可能没有最低限度。用以下内容检查:
for (i in 2:length(x)-1) print(polyfit(i))
我使用as.integer()
函数,因为我不清楚如何解释非整数多项式。
<强>更新强>
另请参阅stepAIC
函数(在MASS包中)以自动选择模型。
答案 3 :(得分:5)
在R中找到最佳拟合的最简单方法是将模型编码为:
lm.1 <- lm(y ~ x + I(x^2) + I(x^3) + I(x^4) + ...)
使用降压AIC回归后
lm.s <- step(lm.1)